Parecer da Comissão Científica

Projeto do CEBIMar

Dados do solicitante

Isabel Ribeiro Oliveira

Natureza do projeto

Projeto de formação discente
Iniciação científica
Kátia Capel
Por favor, selecione

Pesquisadores ou docentes associados

Recursos

Não aplica.
Sem financiamento

Descrição do projeto

Desenvolvimento de um marcador específico para detecção de Tubastraea spp. utilizando DNA ambiental (eDNA).
05-03-2024
31-10-2024
O período das Grandes Navegações, que ocorreu entre os séculos XV e XVII foi de grande importância para novas descobertas ecológicas do mundo natural. Entretanto, essa época também culminou em um dos maiores problemas ambientais que afetam diversas regiões do mundo até hoje. Por conta do avanço do comércio e das inovações de embarcações marítimas, a bioinvasão marinha, muitas vezes proveniente desses grandes meios de transporte, está remodelando a distribuição e os padrões biogeográficos da fauna e da flora em todo o mundo, com centenas de espécies transportadas para novos ambientes todos os anos. Essa chegada desenfreada de novas espécies é, entretanto, responsável por um grande desequilíbrio ecológico da composição natural de habitats. Portanto, métodos rápidos e eficazes para detectar espécies exóticas e invasoras são fundamentais para o sucesso das ações de manejo e controle, visando a preservação da dinâmica ambiental nativa. Nosso objetivo é desenvolver um marcador específico para detecção das espécies de coral-sol, Tubastraea spp., utilizando amostras de DNA ambiental.
Marcadores genéticos, coral-sol, bioinvasão
Utilizando dados genômicos já disponíveis de Tubastraea coccinea, vinte pares de primers foram desenhados utilizando a ferramenta Primer-BLAST e serão testados via amplificação em cadeia da polimerase (PCR). Os primers serão inicialmente testados para as duas espécies de coral-sol registradas na costa brasileira, T. coccinea e T. tagusensis, e o sucesso das amplificações será confirmado através de uma eletroforese em gel de agarose. Os primers que forem amplificados com sucesso serão testados para amplificação por PCR nas demais espécies de corais registradas na costa brasileira para confirmar sua especificidade. Uma vez encontrado um par de primers que amplifique apenas o DNA das espécies do gênero Tubastraea, serão realizados testes de amplificação e sequenciamento em amostras de água coletadas em áreas com e sem a presença do coral-sol (Arquipélago de Alcatrazes e Fernando de Noronha, respectivamente). As amostras de água amplificadas serão sequenciadas utilizando métodos Sanger e a plataforma NextSeq para confirmar sua especificidade. As amostras de coral e de água que serão utilizadas já foram coletadas pelo Laboratório de Evolução e Sistemática de Anthozoa, liderado pelo Prof. Marcelo Kitahara. Para as amostras que ainda não tiveram o seu DNA extraído, será utilizado o kit DNeasy Blood & Tissue (Qiagen).
A primeira etapa consiste no teste de amplificação de 10-30 pares de primers para o grupo alvo, Tubastraea spp., e nas demais espécies de corais registradas na costa brasileira. Os testes serão realizados entre abril e julho de 2024. Uma vez encontrado um marcador específico, os testes em amostras de água serão finalizados até outubro de 2024.

Solicitações

Laboratório molecular e uma mesa para trabalho de computador.
Todos os equipamentos atuais do laboratório molecular.
Não se aplica.
Não se aplica.
Não se aplica.
Não
  • Abril
  • Maio
  • Junho
  • Julho
  • Agosto
  • Setembro
  • Outubro
5
2