Projeto de pesquisa
Parecer da Comissão Científica
Aprovado
Projeto Externo - de Outra Unidade da USP
Dados do solicitante
Lígia Maria Ayres-Ostrock
Natureza do projeto
Projeto de formação discente
Doutorado
Estela Maria Plastino
Por favor, selecione
Pesquisadores ou docentes associados
Recursos
Bolsa de doutorado
Fapesp
Descrição do projeto
Estudos populacionais em Gracilaria birdiae (Gracilariales, Rhodophyta): aspectos fisiológicos e moleculares
17-09-2013
31-10-2014
A diversidade intraespecífica compreende todo o conjunto de expressões fenotípicas em indivíduos de uma determinada espécie, decorrentes tanto do processo de aclimatação quanto da diversidade genética. O uso de marcadores moleculares para estudos sobre a diversidade genética inter e intra-populacionais em macroalgas marinhas está restrito apenas para um número limitado de espécies. O cox 1 (região 5 do gene mitocondrial que codifica para a enzima citocromo c oxidase 1) é um trecho curto de DNA que pode ser prontamente amplificado e sequenciado, tornando-o ideal para detectar espécies proximamente relacionadas e demonstrar diversidades populacionais. Os microssatélites, conhecidos também como Simple Sequence Repeats ou Short Tandem Repeats, vêm sendo utilizados para abordar questões relacionadas à diversidade genética de populações com ampla distribuição geográfica, bem como de uma única população. Gracilaria birdiae é uma das principais agarófitas coletadas no nordeste brasileiro, e diferentes estudos relacionados a sua fisiologia têm possibilitado a caracterização e seleção de linhagens. O atual projeto pretende avaliar a diversidade genética de G. birdiae considerando-se: i, populações selecionadas ao longo da costa brasileira; e ii, suas variantes de cor presentes numa mesma população. Além disso, pretende-se caracterizar essas populações e suas variantes quanto aos parâmetros relacionados à fotossíntese. A diversidade genética será acessada por meio de um marcador presente no genoma mitocondrial, codificante para a enzima citocromo oxidase (cox1), dois marcadores presentes no genoma
G. birdiae, fotossíntese, microssatélites, marcadores moleculares, cox1, rbcL, genética de população, Diving PAM,
Materiais e Métodos
5.1. Material biológico
Populações de Gracilaria birdiae serão amostradas a partir de cinco localidades ao longo da costa brasileira: Ceará (CE), Rio Grande do Norte (RN), Pernambuco (PE), Bahia (BA) e Espírito Santo (ES). Parte do material será preservado em formol 4%, herborizado e depositado no Herbário SPF do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo (USP).
Quando possível, serão reconhecidas variantes de cor na natureza, e essas serão também amostradas. Além do material coletado na natureza, pretende-se avaliar quatro linhagens de gametófitos femininos de Gracilaria birdiae obtidas in vitro a partir de cultivos unialgais:
a. vermelha (VMCE), proveniente do Município de Paracuru, CE (Costa & Plastino, 2001);
b. vermelha (VMES), proveniente do Município de Anchieta, ES (Ursi & Plastino, 2001);
c. marrom-esverdeada (MECE), proveniente do Município de Paracuru, CE (Costa & Plastino, 2001);
d. verde (VDCE), obtida espontaneamente em condições de laboratório (Costa & Plastino, 2001).
5.1. Material biológico
Populações de Gracilaria birdiae serão amostradas a partir de cinco localidades ao longo da costa brasileira: Ceará (CE), Rio Grande do Norte (RN), Pernambuco (PE), Bahia (BA) e Espírito Santo (ES). Parte do material será preservado em formol 4%, herborizado e depositado no Herbário SPF do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo (USP).
Quando possível, serão reconhecidas variantes de cor na natureza, e essas serão também amostradas. Além do material coletado na natureza, pretende-se avaliar quatro linhagens de gametófitos femininos de Gracilaria birdiae obtidas in vitro a partir de cultivos unialgais:
a. vermelha (VMCE), proveniente do Município de Paracuru, CE (Costa & Plastino, 2001);
b. vermelha (VMES), proveniente do Município de Anchieta, ES (Ursi & Plastino, 2001);
c. marrom-esverdeada (MECE), proveniente do Município de Paracuru, CE (Costa & Plastino, 2001);
d. verde (VDCE), obtida espontaneamente em condições de laboratório (Costa & Plastino, 2001).
Ver pdf anexo.
Solicitações
Bancada e trabalho e acesso a água do mar.
Estéreo Microscópio e microscópio.
Algas vermelhas Gracilaria birdiae e G. caudata.
Praia das Cigarras, Martin de Sá, entre outras.
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Por favor, selecione
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