Parecer da Comissão Científica

Aprovado
Projeto do CEBIMar

Dados do solicitante

Cassiano Riyu Kohori

Natureza do projeto

Projeto de formação discente
Doutorado
Marcelo Visentini Kitahara
Por favor, selecione

Pesquisadores ou docentes associados

Recursos

2021/06866-6
Fapesp

Descrição do projeto

CONSEQUÊNCIAS DO EVENTO DE BRANQUEAMENTO DE 2019: DIVERSIDADE GENÉTICA E PADRÕES DE CONECTIVIDADE EM MUSSISMILIA HISPIDA E PORITES ASTREOIDES
02-09-2024
31-07-2028
O ano de 2019 foi marcado por uma das anomalias térmicas marinhas mais severas registrada no
Atlântico Sudoeste, resultando no branqueamento e mortalidade em massa de corais e hidrocorais
ao longo da costa do Brasil. Esses eventos de branqueamento podem agir como filtros seletivos,
resultando na perda da diversidade genética das populações e corais e, consequentemente, tornar
esses os ecossistemas construídos majoritariamente por esses organismos, mais susceptíveis a
distúrbios futuros, como, por exemplo, doenças. Portanto, com o aumento da frequência e
intensidade desses eventos, é de extrema importância entender não só como os corais respondem
a esses estresses, mas também buscar avaliar as consequências, em nível molecular, deixadas por
esses distúrbios nas populações de corais afetadas. Neste sentido, o presente projeto visa avaliar
uma possível mudança na diversidade genética de duas espécies de corais verdadeiros, a saber,
Mussimilia hispida e Porites astreoides em algumas localidades após o evento de branqueamento
de 2019. Em adição, o estudo proposto irá determinar a conectividade das populações ao longo
da costa brasileira, incluindo as localidades de ocorrência mais extremas de ambas as espécies, e
descrever a comunidade microbiana, avaliando possíveis relações entre a conectividade genética
e o microbioma desses corais dentro do contexto evolutivo.
Diversidade genética, branqueamento, microbioma, Porites astreoides, Mussismilia hispida
Diversidade genética e conectividade
O DNA genômico total de todas as amostras será extraído através do kit Qiagen DNeasy
Blood & Tissue, seguindo o protocolo do fabricante. A qualidade do DNA extraído será verificada
através do espectrofotômetro (NanoDrop 2000) e eletroforese em gel de agarose (1,5%). As
bibliotecas de shotgun serão preparadas utilizando o kit TruSeq PCR-Free (Illumina), de acordo
com o protocolo do fabricante, sendo posteriormente sequenciados na plataforma NovaSeq da
Illumina.

Metagenômica de bactérias
O DNA de todas as amostras de M. hispida será extraído através do kit Qiagen DNeasy
PowerSoil Pro, seguindo as instruções do fabricante. A qualidade e pureza do DNA extraído será
observada através do espectrofotômetro (NanoDrop 2000) e eletroforese em gel de agarose
(1,5%). As bibliotecas serão preparadas de acordo com o guia Illumina “16S Metagenomic
Sequencing Library Preparation” e as concentrações finais das amostras serão medidas usando o
kit Qubit dsDNA HS Assay. Uma vez que o pool das bibliotecas esteja preparado, o
sequenciamento será realizado na plataforma MiSeq (Illumina) com o kit MiSeq V3 (600
ciclos) no Centro de Pesquisas da Universidade de São Paulo (CEFAP-USP).
O primeiro semestre será voltado para o cumprimento dos créditos relacionados as
disciplinas do PPGZoo e as análises de bancada, como extrações de DNA, PCR, e preparo de
bibliotecas. Mais coletas serão realizadas possivelmente entre 2024 e 2025 e o processamento
dessas amostras será feito assim que as mesmas estejam disponíveis. Sendo feito o
sequenciamento das amostras, elas serão submetidas as análises de bioinformática (2025-2027) e
os capítulos serão escritos assim que os resultados forem obtidos. O exame de qualificação será
realizado no primeiro semestre de 2026, respeitando o prazo de 24 meses após o início da pós-graduação.

Solicitações

Laboratório de Biologia Molecular
Equipamentos para análises moleculares como termociclador, espectrofotômetro de microvolumes, transiluminador, fonte e cuba de eletroforese, centrífuga, micropipetas.
Não se aplica.
Não se aplica.
Não se aplica.
Não
  • Janeiro
  • Fevereiro
  • Março
  • Abril
  • Maio
  • Junho
  • Julho
  • Agosto
  • Setembro
  • Outubro
  • Novembro
  • Dezembro
20
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