Projeto de pesquisa

As ARMS são esturturas formadas por um conjunto de 9 placas de PVC espaçadas e montadas sobre uma base mais larga do mesmo material. Elas foram instaladas em dois locais, sendo o sítio geladeira no REVIS Alcatrazes e o sítio ESEC, na ESEC Tupinambás, ambos na Ilha de Alcatrazes. Foram instaladas em triplicata a cerca de 10m de profundidade.
Para o processamento as esturturas são cobertas por uma caixa plástica ainda no local, e transportadas por mergulhadores para a embarcação onde são acondicionadas em caixas com águaá do mar filtrada.
Em laboratório as esturturas são desmontadas e as placas mantidas sob aeração em água filtrada. A água da caixa que acondicionada a ARMS é então filtrada em uma série de 3 peneiras para coleta e separaçãoda fauna vágil em 4 frações. Os organimos da macrofauna vágil são contabilizados e amostras coletadas para referência. Demais frações são mantidas em solução de DMSO saturada com sal.
As placas são fotografadas e tem então sua cobertura analisada para identificação a mostragem direta de organismos presentes. Em seguida são raspadas e homogeneizadas em liquidificador. O material é preservado em solução de DMSO saturada com sal, para posterior extração de DNA e análise de metabarcoding.
Etapas posteriores, já em São Paulo, envolvem a análise de cobertura das placas por meio do aplicativo CoralNet. As frações de organismos vágeis menores e da biota séssil tem seu DNA extraído e com o uso de iniciadores com tags se faz a amplificação de regiões do CO1 e 18S para metabarcoding. Os produtos são enviados para sequenciamento e posteriormente analisados em pipeline próprio para remoção dos iniciadores, demultiplexação e identificação dos fragmentos amplificados e sequenciados.