Projeto de pesquisa
Parecer da Comissão Científica
Aprovado
Projeto Externo - de Outra Unidade da USP
Dados do solicitante
Pedro Goulart Suzuki
Natureza do projeto
Projeto de formação discente
Mestrado
Antonio Carlos Marques
Por favor, selecione
Pesquisadores ou docentes associados
Recursos
88887.986002/2024-00
Capes
Descrição do projeto
Regeneração de ctenóforos em condições hipóxicas
10-01-2025
31-08-2026
Regeneração, a capacidade de restaurar partes perdidas do corpo, é um fenômeno observado em vários animais, mas cuja origem evolutiva ainda não é completamente compreendida. Descobertas recentes sugerem que o mecanismo de resposta a ferimentos observado em ctenóforos pode representar um processo regenerativo ancestral conservado ao longo da evolução animal, oferecendo uma perspectiva evolutiva inédita para os estudos em regeneração. De fato, pouco ainda se sabe sobre as adaptações dos primeiros animais às condições paleoambientais em que se originaram, provavelmente durante a Era Neoproterozoica, e particularmente à hipóxia. Se os mecanismos regenerativos presentes nos ctenóforos são, de fato, ancestrais para os metazoários, estes podem incluir adaptações a ambientes hipóxicos, especialmente ao considerar-se a abundância de espécies do grupo em ambientes com baixas concentrações de oxigênio. Este estudo tem como objetivo investigar as possíveis adaptações do mecanismo regenerativo de ctenóforos em relação a condições hipóxicas no nível molecular. Isso será realizado por meio de uma abordagem experimental com análise da resposta de cidipídios do modelo Mnemiopsis leidyi a excisões realizadas em condições hipóxicas controladas. A regeneração efetiva de cidipídios em hipóxia e normóxia será comparada fenotipicamente, por meio de análises visuais sob estereomicroscópio, e genotipicamente, por meio de análises de RNA-seq conduzidas em colaboração com o Martindale laboratory (University of Florida).
Ctenóforos, regeneração, hipóxia, evolução molecular
Espécimes adultos do ctenóforo mnemiopsis leidyi serão coletados no CEBIMar e levados para o Instituto de Biociências em São Paulo onde será realizada sua cultura e, subsequentemente, os experimentos. Apenas a coleta dos animais será realizada no CEBIMar.
A cultura será feita utilizando o método de diffusion tubes proposto por pesquisadores do MBARI para culturas multigeracionais de ctenóforos.
Cidipídios de 1~3mm de largura de M. leidyi serão divididos em dois grupos, um grupo (controle) será deixado em normóxia, o outro grupo (experimental) será exposto a condições hipóxicas. Em seguida serão feitas bissecções nos organismos de ambos os grupos, de modo a deixar o órgão aboral intacto, a regeneração dos organismos dos dois grupos será comparada morfologicamente.
Em seguida, será extraído o RNA dos organismos do grupo controle durante sua regeneração, este RNA será sequenciado com auxilio do Martindale laboratory da Florida University. A biblioteca resultante será comparada com bibliotecas de RNAseq de cidipídios desta mesma espécie regenerando em normóxia previamente sequenciados (https://doi.org/10.1038/s42003-024-05901-7) para identificar potenciais genes/vias relacionados a adaptação à hipóxia.
A cultura será feita utilizando o método de diffusion tubes proposto por pesquisadores do MBARI para culturas multigeracionais de ctenóforos.
Cidipídios de 1~3mm de largura de M. leidyi serão divididos em dois grupos, um grupo (controle) será deixado em normóxia, o outro grupo (experimental) será exposto a condições hipóxicas. Em seguida serão feitas bissecções nos organismos de ambos os grupos, de modo a deixar o órgão aboral intacto, a regeneração dos organismos dos dois grupos será comparada morfologicamente.
Em seguida, será extraído o RNA dos organismos do grupo controle durante sua regeneração, este RNA será sequenciado com auxilio do Martindale laboratory da Florida University. A biblioteca resultante será comparada com bibliotecas de RNAseq de cidipídios desta mesma espécie regenerando em normóxia previamente sequenciados (https://doi.org/10.1038/s42003-024-05901-7) para identificar potenciais genes/vias relacionados a adaptação à hipóxia.
1. Montagem dos diffusion tubes (completo)
2. Coleta dos animais
3. Bissecções e análise da regeneração
4. Extração de RNA
5. Sequênciamento do RNA
6. Análise da biblioteca produzida e compilação dos resultados
2. Coleta dos animais
3. Bissecções e análise da regeneração
4. Extração de RNA
5. Sequênciamento do RNA
6. Análise da biblioteca produzida e compilação dos resultados
Solicitações
Bancada
Estereomicroscópio
Mnemiopsis leidyi
Praia do Cabelo Gordo de Fora
Praia do Cabelo Gordo de Dentro
Praia do Cabelo Gordo de Dentro
Não se aplica
- Auxílio técnico para coleta de organismos ou observações de campo
- Utilização de embarcação do CEBIMar
- Janeiro
2
1